蛋白质鉴定

药代 1270
一、项目介绍

  Nano LC-MS/MS技术是当前鉴定凝胶(包括二维凝胶)分离的蛋白胶带最灵敏、最可靠的方法。与MALDI-TOF的蛋白质鉴定方法相比,NanoLC-MC/MS具有更高的灵敏度和几乎100%的可靠性,而且具有MALDI-

TOF不可比拟的从单一蛋白质胶带中准确鉴定出多个蛋白质组分的能力。

  质谱鉴定的原理则是基于鸟枪法(Shot-gun):将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,再在线导入高分辨率质谱仪中进行分析。肽段在质谱仪中离子化后,会带

上一定量的电荷,通过检测器分析,可得到各肽段的质荷比(m/z),从而得知各肽段的相对分子质量。为获得肽段的序列信息,质谱仪会选取某些肽段进行破碎,再次分析,获得二级质谱,检索软件根据二级质谱信息

与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。

  主要设备:质谱仪 Thermo Q Exactive / AB Secix 5600+

二、应用

  可用于多种类型样品中蛋白质的鉴定,包括:1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条,2DE PAGE中的蛋白胶点,蛋白表达产物,免疫共沉淀(Co-IP)样品,组织全蛋白谱,蛋白溶液样本等。

三、样品保存运输

  1、胶点/胶条样本
  ①蛋白量大于100ng,4℃保存,冰袋运输。
  ②收集时,用双蒸水对胶块进行清洗,采用干净刀片将目的条带区域(避免带入空白或非目的区域)切下,装入EP管中保存。
  ③考染胶条,需要条带肉眼清晰可见,银染胶条不建议进行蛋白质鉴定(银染需专用质谱兼容试剂盒银染)。
  ④不同条带不建议混合处理,避免干扰。
  ⑤提供样本时需提供胶块考染图和样品取点图。

  2、蛋白溶液样本

  ①蛋白量至少大于10ug,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②建议测定蛋白浓度后,液氮速冻,避免蛋白降解,另外需要告知蛋白溶液的缓冲液成分和浓度,方便实验室收到后进行后续处理。
  ③样本若为IP实验后磁珠-抗体-蛋白复合物,注意不要加入loading buffer,应采用wash buffer清洗后,离心去掉上清,重复三次,再使用PBS冲洗磁珠三次,去上清,收集磁珠沉淀。

  3、细胞样本

  ①细胞量1×107个,收集细胞沉淀,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。

  4、血清样本

  ①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样本应尽量避免溶血。

  5、血浆样本

  ①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样本应尽量避免溶血。

  6、尿液样本

  ①样本量2mL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样品应尽量避免带入粪便残渣。

  7、动物组织样本

  ①样本量300mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面血液,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
  ③固定液浸泡过的样本无法进行检测。

  8、植物组织样本

  ①样本量500mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面泥沙,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
  ③固定液浸泡过的样本无法进行检测。

  9、微生物样本

  ①样本量干重200mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。

四、结果展示

 
五、价格列表

服务项目 项目编号 项目名称 价格 单位
蛋白质
鉴定
GA1046 蛋白质鉴定,30分钟 1000 元/个
蛋白质鉴定,100分钟 2000 元/个

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