Nano LC-MS/MS技术是当前鉴定凝胶(包括二维凝胶)分离的蛋白胶带最灵敏、最可靠的方法。与MALDI-TOF的蛋白质鉴定方法相比,NanoLC-MC/MS具有更高的灵敏度和几乎100%的可靠性,而且具有MALDI-
TOF不可比拟的从单一蛋白质胶带中准确鉴定出多个蛋白质组分的能力。
质谱鉴定的原理则是基于鸟枪法(Shot-gun):将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,再在线导入高分辨率质谱仪中进行分析。肽段在质谱仪中离子化后,会带
上一定量的电荷,通过检测器分析,可得到各肽段的质荷比(m/z),从而得知各肽段的相对分子质量。为获得肽段的序列信息,质谱仪会选取某些肽段进行破碎,再次分析,获得二级质谱,检索软件根据二级质谱信息
与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。
主要设备:质谱仪 Thermo Q Exactive / AB Secix 5600+
二、应用
可用于多种类型样品中蛋白质的鉴定,包括:1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条,2DE PAGE中的蛋白胶点,蛋白表达产物,免疫共沉淀(Co-IP)样品,组织全蛋白谱,蛋白溶液样本等。
三、样品保存运输
1、胶点/胶条样本
①蛋白量大于100ng,4℃保存,冰袋运输。
②收集时,用双蒸水对胶块进行清洗,采用干净刀片将目的条带区域(避免带入空白或非目的区域)切下,装入EP管中保存。
③考染胶条,需要条带肉眼清晰可见,银染胶条不建议进行蛋白质鉴定(银染需专用质谱兼容试剂盒银染)。
④不同条带不建议混合处理,避免干扰。
⑤提供样本时需提供胶块考染图和样品取点图。
2、蛋白溶液样本
①蛋白量至少大于10ug,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②建议测定蛋白浓度后,液氮速冻,避免蛋白降解,另外需要告知蛋白溶液的缓冲液成分和浓度,方便实验室收到后进行后续处理。
③样本若为IP实验后磁珠-抗体-蛋白复合物,注意不要加入loading buffer,应采用wash buffer清洗后,离心去掉上清,重复三次,再使用PBS冲洗磁珠三次,去上清,收集磁珠沉淀。
3、细胞样本
①细胞量1×107个,收集细胞沉淀,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。
4、血清样本
①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
5、血浆样本
①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
6、尿液样本
①样本量2mL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样品应尽量避免带入粪便残渣。
7、动物组织样本
①样本量300mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面血液,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
8、植物组织样本
①样本量500mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面泥沙,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
9、微生物样本
①样本量干重200mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。
四、结果展示
五、价格列表
服务项目 | 项目编号 | 项目名称 | 价格 | 单位 |
蛋白质 鉴定 |
GA1046 | 蛋白质鉴定,30分钟 | 1000 | 元/个 |
蛋白质鉴定,100分钟 | 2000 | 元/个 |
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