SWATH定量蛋白质组学

药代 4160
一、项目介绍

  SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。

  基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集(Data Independent Acquisition, DIA)是赛默飞为用户带来的一项全新的、全息式的质谱技术。DIA 将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个

窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。因此,SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。SWATH综合了shotgun proteomics高通量检测的特点与精准定量分析的优势,是真正意义上的全景质谱检测手段MS/MS ALL。

  SWATH/DIA是对样品中的所有分子无差别地进行分析,并一次性将所有肽段的MS,MS/MS数据进行储存,以保证不遗漏任何可能重要的数据。总的来说,SWATH极大地提高了定量分析的可信度,并能够高效测

定复杂样品中丰度极低的蛋白分子。

  主要设备:质谱仪 Thermo Q Exactive / AB Secix 5600+

二、应用

  SWATH技术广泛用于食品检测,环境分析,药物开发他领域提供支持,并且在蛋白质组学研究中得到大量运用,获取样品中低丰度蛋白的信息。

三、样品保存运输

  1、蛋白样本
  ①蛋白量大于100ug,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②胶条、胶点样本不建议进行定量蛋白质组学。

  2、细胞样本

  ①细胞量1×107个,收集细胞沉淀,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。

  3、血清样本

  ①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样本应尽量避免溶血。

  4、血浆样本

  ①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样本应尽量避免溶血。

  5、尿液样本

  ①样本量2mL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②样品应尽量避免带入粪便残渣。

  6、动物组织样本

  ①样本量300mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面血液,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
  ③固定液浸泡过的样本无法进行检测。

  7、植物组织样本

  ①样本量500mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面泥沙,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
  ③固定液浸泡过的样本无法进行检测。

  8、微生物样本

  ①样本量干重200mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
  ②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。

四、结果展示

 
五、价格列表

服务项目 项目编号 项目名称 价格 单位
非标记定量
蛋白质组学
  SWATH定量蛋白质组学 6000 元/个

 
 

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